Глубина цвета в приложении терминальных приложениях (RemoteApp) по умолчанию выставляется 15 бит, с этим связано появления некоторых артефактов в частности в 1с не видно выделенного пункта меню, если зайти через RDP клиента все отлично отображается. Итак глубина цвета на сервере через GUI принудительно не выставляется. Чтобы выставить глубину цвета RemoteApp нужно файл запуска *.rdp открыть блокнотом и выставить "session bpp:i:16".